MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid At

Total Repeats: 10610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003064	CGA	2	6	107773	107778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119329
2002	NC_003064	CGG	4	12	107788	107799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119329
2003	NC_003064	TGT	2	6	107827	107832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119329
2004	NC_003064	GCCGC	2	10	107921	107930	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2005	NC_003064	GCA	2	6	107953	107958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_003064	T	7	7	107959	107965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_003064	GAC	2	6	108050	108055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119330
2008	NC_003064	GC	3	6	108057	108062	0 %	0 %	50 %	50 %	16119330
2009	NC_003064	GCG	2	6	108069	108074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119330
2010	NC_003064	GCC	2	6	108124	108129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119330
2011	NC_003064	TCTG	2	8	108198	108205	0 %	50 %	25 %	25 %	16119330
2012	NC_003064	CCCT	2	8	108308	108315	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2013	NC_003064	TGA	2	6	108318	108323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_003064	ACG	2	6	108327	108332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_003064	TCC	2	6	108393	108398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_003064	CG	3	6	108422	108427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2017	NC_003064	AGG	2	6	108430	108435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_003064	CAT	2	6	108445	108450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_003064	CGG	2	6	108515	108520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_003064	TGA	2	6	108524	108529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_003064	CGC	2	6	108688	108693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_003064	GGC	2	6	108696	108701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_003064	GCCT	2	8	108768	108775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2024	NC_003064	ACC	2	6	108891	108896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2025	NC_003064	TCAA	2	8	108923	108930	50 %	25 %	0 %	25 %	159186490
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2027	NC_003064	TCG	2	6	109090	109095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186490
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2030	NC_003064	CGGTC	2	10	109277	109286	0 %	20 %	40 %	40 %	159186490
2031	NC_003064	GCC	2	6	109299	109304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186490
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2034	NC_003064	CCGG	2	8	109424	109431	0 %	0 %	50 %	50 %	159186490
2035	NC_003064	GGC	2	6	109463	109468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186490
2036	NC_003064	CATC	2	8	109497	109504	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_003064	CGG	2	6	109506	109511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_003064	CGA	2	6	109538	109543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_003064	ACG	2	6	109607	109612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_003064	TCCG	2	8	109672	109679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2041	NC_003064	CCT	2	6	109813	109818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2042	NC_003064	GTT	2	6	109823	109828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_003064	GAAAA	2	10	109931	109940	80 %	0 %	20 %	0 %	16119332
2044	NC_003064	GC	3	6	109952	109957	0 %	0 %	50 %	50 %	16119332
2045	NC_003064	CGTC	2	8	110009	110016	0 %	25 %	25 %	50 %	16119332
2046	NC_003064	TGC	2	6	110107	110112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119332
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2049	NC_003064	ACG	2	6	110217	110222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119332
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2052	NC_003064	CGA	2	6	110405	110410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119332
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2054	NC_003064	CGG	2	6	110444	110449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119332
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2057	NC_003064	CGGA	2	8	110613	110620	25 %	0 %	50 %	25 %	16119332
2058	NC_003064	GAA	2	6	110631	110636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119332
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2061	NC_003064	CGA	2	6	110842	110847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119332
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2063	NC_003064	GGA	2	6	110940	110945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_003064	TGC	2	6	110987	110992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_003064	AGCA	2	8	111044	111051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2066	NC_003064	GCC	2	6	111082	111087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2067	NC_003064	CGAT	2	8	111150	111157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2068	NC_003064	TGC	2	6	111166	111171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2088	NC_003064	ATCGAG	2	12	112288	112299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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2092	NC_003064	C	6	6	112361	112366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2093	NC_003064	TGA	2	6	112367	112372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2104	NC_003064	TCG	2	6	113181	113186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_003064	GTC	2	6	113234	113239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2107	NC_003064	GCG	2	6	113306	113311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_003064	CGA	2	6	113316	113321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2110	NC_003064	TG	3	6	113674	113679	0 %	50 %	50 %	0 %	16119337
2111	NC_003064	CGGC	2	8	113700	113707	0 %	0 %	50 %	50 %	16119337
2112	NC_003064	GCGG	2	8	113823	113830	0 %	0 %	75 %	25 %	16119337
2113	NC_003064	CAT	2	6	113943	113948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119337
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2119	NC_003064	TCTT	2	8	114154	114161	0 %	75 %	0 %	25 %	16119337
2120	NC_003064	GCA	2	6	114350	114355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119337
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2125	NC_003064	CAA	2	6	114632	114637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119337
2126	NC_003064	ACG	2	6	114742	114747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119337
2127	NC_003064	TGG	2	6	114752	114757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119337
2128	NC_003064	CCA	2	6	114766	114771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119337
2129	NC_003064	GAA	2	6	114780	114785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119337
2130	NC_003064	TCGAA	2	10	114797	114806	40 %	20 %	20 %	20 %	16119337
2131	NC_003064	CAG	2	6	114822	114827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119337
2132	NC_003064	CCA	2	6	114838	114843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119337
2133	NC_003064	CAT	2	6	114935	114940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119337
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2139	NC_003064	CT	3	6	115138	115143	0 %	50 %	0 %	50 %	16119337
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2143	NC_003064	GCCG	2	8	115344	115351	0 %	0 %	50 %	50 %	16119337
2144	NC_003064	CCA	2	6	115459	115464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119338
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2147	NC_003064	TC	3	6	115656	115661	0 %	50 %	0 %	50 %	16119338
2148	NC_003064	CTT	2	6	115667	115672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119338
2149	NC_003064	GCTT	2	8	115756	115763	0 %	50 %	25 %	25 %	16119339
2150	NC_003064	TCG	2	6	115795	115800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119339
2151	NC_003064	CCT	2	6	115814	115819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119339
2152	NC_003064	ATCTCC	2	12	115828	115839	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16119339
2153	NC_003064	TCG	2	6	115853	115858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119339
2154	NC_003064	CG	3	6	115864	115869	0 %	0 %	50 %	50 %	16119339
2155	NC_003064	TTCG	2	8	115904	115911	0 %	50 %	25 %	25 %	16119339
2156	NC_003064	TGG	2	6	115955	115960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119339
2157	NC_003064	AGC	2	6	116101	116106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2158	NC_003064	CAG	2	6	116219	116224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2159	NC_003064	GCC	3	9	116250	116258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
2160	NC_003064	TGG	2	6	116278	116283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186494
2161	NC_003064	CCT	2	6	116299	116304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186494
2162	NC_003064	GGC	3	9	116316	116324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186494
2163	NC_003064	GAG	2	6	116340	116345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186494
2164	NC_003064	TGC	2	6	116350	116355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2165	NC_003064	GC	3	6	116378	116383	0 %	0 %	50 %	50 %	159186494
2166	NC_003064	CGT	2	6	116402	116407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2167	NC_003064	ATC	2	6	116484	116489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186494
2168	NC_003064	AGGCA	2	10	116598	116607	40 %	0 %	40 %	20 %	159186494
2169	NC_003064	CA	3	6	116611	116616	50 %	0 %	0 %	50 %	159186494
2170	NC_003064	TGA	2	6	116623	116628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186494
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2174	NC_003064	GCCG	2	8	116954	116961	0 %	0 %	50 %	50 %	159186494
2175	NC_003064	CG	3	6	116966	116971	0 %	0 %	50 %	50 %	159186494
2176	NC_003064	GCT	2	6	116993	116998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186494
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2179	NC_003064	CGA	2	6	117089	117094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186494
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2183	NC_003064	CAT	2	6	117384	117389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186494
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2185	NC_003064	GCT	2	6	117449	117454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186494
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2187	NC_003064	ACC	2	6	117487	117492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186494
2188	NC_003064	GCG	2	6	117504	117509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186494
2189	NC_003064	GGC	2	6	117521	117526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186494
2190	NC_003064	CGG	2	6	117615	117620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186494
2191	NC_003064	TCG	2	6	117654	117659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186494
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2199	NC_003064	GAG	2	6	117870	117875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186494
2200	NC_003064	TTG	2	6	117907	117912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186494
2201	NC_003064	TTG	2	6	117946	117951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186494
2202	NC_003064	CGC	2	6	117969	117974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
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2212	NC_003064	GAT	2	6	118436	118441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186494
2213	NC_003064	ACGT	2	8	118455	118462	25 %	25 %	25 %	25 %	159186494
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2215	NC_003064	GAC	2	6	118659	118664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186494
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2218	NC_003064	GTGACG	2	12	118770	118781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159186494
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2221	NC_003064	ACGG	2	8	118826	118833	25 %	0 %	50 %	25 %	159186494
2222	NC_003064	TCGA	2	8	118834	118841	25 %	25 %	25 %	25 %	159186494
2223	NC_003064	GAG	3	9	118896	118904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186494
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2225	NC_003064	GAC	3	9	118964	118972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186494
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2227	NC_003064	CGGGG	2	10	119075	119084	0 %	0 %	80 %	20 %	159186494
2228	NC_003064	TGGC	2	8	119097	119104	0 %	25 %	50 %	25 %	159186494
2229	NC_003064	ACA	2	6	119259	119264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186494
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2231	NC_003064	CGC	2	6	119295	119300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
2232	NC_003064	GGAA	2	8	119323	119330	50 %	0 %	50 %	0 %	159186494
2233	NC_003064	TTC	2	6	119341	119346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186494
2234	NC_003064	GC	3	6	119383	119388	0 %	0 %	50 %	50 %	159186494
2235	NC_003064	GCTT	2	8	119405	119412	0 %	50 %	25 %	25 %	159186494
2236	NC_003064	CG	3	6	119417	119422	0 %	0 %	50 %	50 %	159186494
2237	NC_003064	CGA	2	6	119444	119449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2238	NC_003064	CGC	2	6	119461	119466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
2239	NC_003064	GGATC	2	10	119487	119496	20 %	20 %	40 %	20 %	159186494
2240	NC_003064	CG	3	6	119511	119516	0 %	0 %	50 %	50 %	159186494
2241	NC_003064	GCG	2	6	119535	119540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186494
2242	NC_003064	TGC	2	6	119560	119565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2243	NC_003064	CCG	2	6	119594	119599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
2244	NC_003064	GAG	2	6	119625	119630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186494
2245	NC_003064	GCG	2	6	119633	119638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186494
2246	NC_003064	GC	3	6	119685	119690	0 %	0 %	50 %	50 %	159186494
2247	NC_003064	CGG	2	6	119758	119763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186494
2248	NC_003064	G	6	6	119791	119796	0 %	0 %	100 %	0 %	159186494
2249	NC_003064	ACG	2	6	119800	119805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2250	NC_003064	CGCT	2	8	119813	119820	0 %	25 %	25 %	50 %	159186494
2251	NC_003064	GAC	2	6	119889	119894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2252	NC_003064	GCC	2	6	119934	119939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
2253	NC_003064	CGC	2	6	119943	119948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
2254	NC_003064	GAA	2	6	119955	119960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186494
2255	NC_003064	GAAAG	2	10	119973	119982	60 %	0 %	40 %	0 %	159186494
2256	NC_003064	CGT	2	6	120011	120016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2257	NC_003064	CGC	2	6	120137	120142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
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2261	NC_003064	GAG	2	6	120432	120437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186494
2262	NC_003064	CCG	2	6	120478	120483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
2263	NC_003064	GA	3	6	120494	120499	50 %	0 %	50 %	0 %	159186494
2264	NC_003064	GAA	2	6	120515	120520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186494
2265	NC_003064	GCTC	2	8	120550	120557	0 %	25 %	25 %	50 %	159186494
2266	NC_003064	CGA	2	6	120602	120607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186494
2267	NC_003064	GCC	2	6	120662	120667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186494
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2269	NC_003064	AATG	2	8	120811	120818	50 %	25 %	25 %	0 %	159186494
2270	NC_003064	TGCGT	2	10	120867	120876	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2271	NC_003064	CAC	2	6	121057	121062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119341
2272	NC_003064	CGGC	2	8	121091	121098	0 %	0 %	50 %	50 %	16119341
2273	NC_003064	CG	3	6	121192	121197	0 %	0 %	50 %	50 %	16119341
2274	NC_003064	GCC	2	6	121248	121253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119341
2275	NC_003064	CG	3	6	121328	121333	0 %	0 %	50 %	50 %	16119341
2276	NC_003064	GCT	2	6	121347	121352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119341
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2279	NC_003064	TAT	2	6	121585	121590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119341
2280	NC_003064	GCA	2	6	121649	121654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119341
2281	NC_003064	CT	3	6	121691	121696	0 %	50 %	0 %	50 %	16119341
2282	NC_003064	GAA	2	6	121785	121790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119341
2283	NC_003064	A	6	6	121789	121794	100 %	0 %	0 %	0 %	16119341
2284	NC_003064	TAGGC	2	10	121812	121821	20 %	20 %	40 %	20 %	16119341
2285	NC_003064	TCGT	2	8	122084	122091	0 %	50 %	25 %	25 %	16119341
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2289	NC_003064	GGC	2	6	122325	122330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119341
2290	NC_003064	GGA	2	6	122345	122350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2291	NC_003064	TGT	2	6	122456	122461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17938699
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2293	NC_003064	GCT	2	6	122708	122713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119342
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2295	NC_003064	CTT	2	6	122732	122737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119342
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2299	NC_003064	CT	3	6	123319	123324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2300	NC_003064	CTGC	2	8	123412	123419	0 %	25 %	25 %	50 %	16119343
2301	NC_003064	GAG	2	6	123437	123442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119343
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2310	NC_003064	TAA	2	6	123725	123730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2311	NC_003064	AAC	2	6	123822	123827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2312	NC_003064	TCA	2	6	123838	123843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2313	NC_003064	TTCC	2	8	123844	123851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2314	NC_003064	TTC	2	6	123856	123861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2315	NC_003064	GCC	2	6	123907	123912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2316	NC_003064	AAGTTA	2	12	123926	123937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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2319	NC_003064	AT	3	6	124020	124025	50 %	50 %	0 %	0 %	159186495
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2322	NC_003064	GCTC	2	8	124067	124074	0 %	25 %	25 %	50 %	159186495
2323	NC_003064	CTGA	2	8	124096	124103	25 %	25 %	25 %	25 %	159186495
2324	NC_003064	CT	3	6	124164	124169	0 %	50 %	0 %	50 %	159186495
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2330	NC_003064	GTC	2	6	124474	124479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186495
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2342	NC_003064	CAA	2	6	124982	124987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2343	NC_003064	CGC	2	6	125008	125013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2351	NC_003064	TTC	2	6	125600	125605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119345
2352	NC_003064	CTC	2	6	125755	125760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119345
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2354	NC_003064	CAT	2	6	125863	125868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119345
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2360	NC_003064	CAGTG	2	10	126035	126044	20 %	20 %	40 %	20 %	16119345
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2365	NC_003064	TGC	3	9	126281	126289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119345
2366	NC_003064	GTCG	2	8	126295	126302	0 %	25 %	50 %	25 %	16119345
2367	NC_003064	ATGC	2	8	126331	126338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2368	NC_003064	CAA	2	6	126364	126369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2369	NC_003064	TGA	2	6	126485	126490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119346
2370	NC_003064	CGC	2	6	126501	126506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119346
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2495	NC_003064	CAA	2	6	132317	132322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2496	NC_003064	TGA	2	6	132328	132333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_003064	CCCT	2	8	132411	132418	0 %	25 %	0 %	75 %	16119352
2498	NC_003064	CGC	2	6	132434	132439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119352
2499	NC_003064	GCCG	2	8	132446	132453	0 %	0 %	50 %	50 %	16119352
2500	NC_003064	GC	3	6	132554	132559	0 %	0 %	50 %	50 %	16119352

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